文章目录

1 材料与方法

1.1 蓝尾蝾螈皮肤总RNA提取和检测

1.2 cDNA文库的构建及测序

1.3 测序数据处理和生物信息学分析

2 结果与分析

2.1 蓝尾蝾螈皮肤总RNA质检数据

2.2 测序数据结果

2.3 功能注释

2.4 蓝尾蝾螈皮肤活性多肽

    2.4.1 神经肽FF和神经肽AF

    2.4.2胸腺肽β4

    2.4.3 C型利钠肽

    2.4.4 降钙素基因相关肽

    2.4.5 cathelicidin类抗菌肽

3 讨论与结论

文章摘要:通过对蓝尾蝾螈皮肤进行转录组测序,首次报道了蓝尾蝾螈皮肤的转录组及其活性多肽成分.采用Illumina Hiseq4000共测定了6.65 Gb数据;组装和去冗余后共获得75 462个unigene,其N50、GC含量、平均长度、总长度分别为1 617 bp、45.64%、818 bp、61 801 999 bp.通过基因注释,共获得34 850个非冗余注释unigene（占unigene总数的46.18%）,注释结果为两栖类物种的unigene数目约占注释总数的16%.根据unigene的COG和GO注释结果,统计了各自的功能分类.其中,对鉴定到的多种活性多肽进行了初步的生物信息学分析,为诠释蓝尾蝾螈皮肤生理学功能提供依据.

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